合作一事在双方不断地跑动下缓慢地进展，最后双方达成的协议内大概有几条：
1、宇智波编入常规部队，警备部不再专门由宇智波负责，而是与结界班组合成安全部，负责木叶安全。警备部不安排常驻人员，而是由常规部队的忍者轮班负责巡逻。
2、监狱看守重新从各部门抽调，不由宇智波包揽。
3、有关木叶的重大决策，不能将宇智波排除在外。
4、成立纠纷局，又平民组成，专管平民之间的纠纷。但每月需要对火影汇报。
里面还有很多条，但九雀并不是非常清楚。想必在初期，宇智波和火影都会监视对方，如果发展理想的话，就能解除怀疑了。虽说火影派不能将宇智波排除在各部管理层外，但是宇智波想要获得权力就要用战功换，这也是公平的。九雀完成任务之后就不管这件事了，她的能力有限，这种厉害的事情就交给火影他们去做吧！
之后九雀又过上了出出任务、和卡卡西斗嘴的生活。木叶度过了休整期，任务也变得高级起来，作为暗部负伤都习惯了。暗部的医疗部只是负责提供各种药剂和兵粮丸，受伤还是得去木叶医院的，九雀对那里的医疗忍者有些发憷——她总是遇上一个超级严厉的医疗忍者。受伤又不是她愿意的！不要一遍遍重复那些注意事项了！
这一次九雀伤了胳膊和肩胛处的肌肉，只需要缝几针就行了。卡卡西比她惨多了，需要留院观察——这家伙真的是一定要赶尽杀绝才罢手，队长都说不用追了，他还是坚持将敌人全灭。九雀对他的自作孽一点也不同情，还打算在离开之前去探望他一下。那个罗里吧嗦的医疗忍者给她缝好了肩胛上的伤口，然后让一个实习生帮她包扎手臂。“伤口很浅，很快就会愈合的。注意洗澡的时候不能碰到水。”帮她包扎的是个小不点，但是手法很纯熟，那些絮絮叨叨的话用软软的童音说出来一点也不惹人烦，瞬间将九雀治愈了。
老女人什么的去死吧！这才是她的爱啊！九雀一把抱住小正太，瞬间那颗汉子心中隐藏的糙妹成分得到了满足。“我要把这个手札带回去！”“你又在发什么神经。”大蛇丸只是来拿些草药的，听说九雀在这里，就来望一眼，正巧看到九雀调戏人家小正太。九雀怀里的那人看见大蛇丸，瑟缩了一下，显然是认得的。九雀这才认出抱着的是谁：六岁左右，银色短发的小男孩，而且会医疗忍术，不就是药师兜嘛！
九雀讪讪地放了手：真是抱歉，调戏了你的未来手下加绯闻小受。“哟，大蛇丸老师！”“哟你个头！”大蛇丸一巴掌呼在她后脑勺上，“你能不能有一秒钟是安分的？”真是每一分钟都在丢脸，这家伙是专注给他抹黑一百年吗？九雀很是委屈：“我又没有做什么。”大蛇丸瞥了兜一眼，发现是他一直关注的孩子，顿感九雀招惹是非的能力太强了。他让兜现行离开，然后环臂站在九雀跟前：“你以为是小猫小狗可以随便带回家的吗？”
“因为他长着一张让人想要揉捏的脸。”小时候的兜超级萌的，长大之后就奸诈如狐，真叫人伤感。大蛇丸挑起嘴角：“你什么时候那么像个女性了？”“你很失礼知不知道！”九雀大叫起来，立刻得到了医疗忍者的怒斥。大蛇丸戳她的额头：“少给我惹事。”“嘿！你为什么认准了我惹事啊？我明明只是想要一个卡哇伊的弟弟而已。”大蛇丸看了看她，随后问她接下来还有没有事，九雀说没有，他就把人拎走了。
大蛇丸走在前面，九雀老老实实地跟在后面。他们住的地方较为偏远，他们走了一阵都没有遇上人。“你到底知道些什么，九雀？”大蛇丸突然问，吓了九雀一跳。大蛇丸转过身来，那双金色眼睛冷冰冰的，让九雀浑身难受，“你似乎有很多秘密。”九雀僵硬住了，想说些什么，但是说不出来，只能愣愣地看着大蛇丸像她伸出手。耳朵里“轰隆隆”的满是血液流淌的声音，心脏跳得像是要爆炸了。那只手最终落到了她的脑袋上，“这些我都不在乎，只要你乖乖听话。不要去招惹那个药师兜。”
“他怎么了？”大蛇丸看了她几秒来确认她是否真的不认识兜，随后道：“他是桔梗山战场上捡回了的敌国遗孤。”“我看他不满十岁，难道是间谍？”九雀是知道兜的底细的，但要大蛇丸说出来，她才能正当地知道那些。大蛇丸笑起来：“是间谍没错，不过是木叶的。对于这种收养的孩子，木叶向来是培养成间谍使用的，即使死了也不会有损失。不过他的资料都是我伪造的。他是团藏从一个孤儿院带回来的，为得是要挟院长——原来的顶级间谍继续帮他卖命。我只知道这小子有学习医疗忍术的天赋，没想到当间谍也很有一套，第一次任务就成功了。”
“大蛇丸老师是想要这个孩子吗？”九雀问，“不然用不着对他那么在意吧？”大蛇丸总觉得九雀的话有些奇怪，但意思又没错，他的确想要招揽兜。“我还在观察呢，他现在还算是团藏的人。”大蛇丸对感兴趣的事情向来有耐心。团藏手里掌握着药师野乃宇，就能控制兜，而知道团藏计划的大蛇丸就等着兜崩溃的那一刻一举拿下。
“哦哦，那么我接近他也没有关系了吧？可以事先建立感情什么的。”“你只是想要人家才是吧？前几天你是不是对夕日红下手了？”大蛇丸斜了她一眼。九雀直跳脚：“不要说得我好像变态色、魔一样！我只是和小伙伴进行了友好的沟通而已！”对这种说法，大蛇丸回以白眼：如果那种举动算是正常的朋友交流的话，怎样的才算是调戏？“如果你对卡卡西之类的这样做，只能算你好色，对同为女人的红下手，你算什么啊？”
九雀的脑门上密布着跳动的十字：“不要用‘下手’这个词不行吗？有阿斯玛那个门神在我连摸都没摸到啊！”大蛇丸嘴角一抽：你到底想要做到何种地步才满足啊？
不管怎样，大蛇丸不禁止她解除兜了。九雀倒不是想要利用兜做什么，在遇到他之前都没想起这号人，不过那日一见，被萌的满心泪——想不到她也有被小正太迷住的一天！
兜才刚刚进入木叶，因为挂在医疗班班长的名字下，所以他是要学医疗忍术的。其余的时间在根接受间谍训练，目前接过一次任务。他一直想要见野乃宇，但是团藏说要他们完成任务之后才能见面。兜现在对木叶挺喜欢的，虽然做间谍很危险，但是他还是挺喜欢木叶的。不过要是没有这个奇怪的大姐姐就更好了。
兜这样想着，瘫着脸看着又溜进医院的九雀，对于这个把“诱拐”两字写在脸上的暗部，他真心是连敷衍都懒得了。“兜子~”九雀给了他一个熊抱，真庆幸她起码要比兜高，否则她非得羞愤致死！兜早就不去争辩称呼问题了，推开她转身去给一个病人调点滴速度了。九雀露出伤心欲绝的表情。
“哟，九雀。”一个声音从大厅的另一端传过来，九雀转身就被一道亮光闪瞎了眼。凯龇着牙，一手还扎在点滴的针，坐在椅子上也不安分。“哦，凯。”九雀走过去，“你怎么了？”“感冒，最近有很多人得。”凯揉了揉鼻子。九雀在心里想：不是说白痴是不会感冒的吗？凯除了鼻子有些红外，倒也看不出生病了，此时满脸八卦地凑过来：“你和那个小子是怎么回事？难道你喜欢小你那么多的？”九雀一击手刀劈在他头上：“少瞎说。”
凯的身体的强韧指数超乎常人，也被这一下打的飙泪：次奥，这家伙瘦瘦小小的力气怎么那么大！“嗯……想也是，你应该喜欢成熟的。”“何以见得？”为什么你一副很是了解的表情？我们明明不熟好吗？凯举例道：“你以前调戏的卡卡西和红都是那种类型的，比较man或者有这个。”他比划了一个胸部的形状。九雀赶忙叫停：“红我承认，卡卡西算什么？小爷没有碰他一个指头！”为什么他们都觉得她和卡卡西有一腿？
这时一个护士叫兜把放盐水瓶的推车推过来，九雀瞟了一眼，那个推车跟兜一样高，立马飞过去：“我来！”凯看着无比荡漾的九雀满头黑线，他这颗不擅长思考的大脑越来越搞不懂这个同伴的想法了。九雀一直坚持赖到了医院下班的时间，还邀请兜去吃一乐拉面。兜忍无可忍：“你到底想干什么啊？”九雀想了想，摸着下巴一本正经地回答：“只是觉得凑齐一套比较好。”兜本以为她不是别有用心就是有奇怪癖好，结果得了这么一句，立刻傻了，“哈？”
怎么说呢，就像福尔摩斯身边得有华生一样，大蛇丸身边没有兜的话总觉得少了些什么。虽说几年后大蛇丸就会得到兜，但目前剧情已经被她扇得千疮百孔了，谁知道会不会出现什么意想不到的问题。而且看到未来的贼狐狸，耍了忍者联军八万人的兜在自己手下被整的没办法，只能瘫着脸强撑实在是太有成就感了！
“别理她，她脑子有问题。”卡卡西顺着走廊走过来，随口对兜道。九雀满脑门跳动着青筋：第三次了！第三次这样说她了！真心够了！“呀，卡卡西，你又拄拐杖了啊！”声音里的幸灾乐祸都要溢出来了。卡卡西送了她一个白眼：“好不容易休假，你到底是多精力旺盛。”“总比将假期全都奉献给了养病的某人好。”九雀抖着腿，斜眼瞧他，将鄙视之情尽可能地表现出来。卡卡西挑挑眉，伸手将兜拎到一边——即使拄着拐杖，他也强出兜很多——往九雀跟前进了一步，利用身高优势压迫她。“辻九雀，咱们出去聊聊。”
九雀浑身的刺都竖起来了，摆出戒备的姿势：“你要做什么！”卡卡西“哼哼”一笑，一手抓住九雀的后领提了起来，一手撑着拐杖往医院的后花园走。介于两人的身高差，九雀处于双脚离地的状态，火大的只想把这只白毛稻草人戳个三刀六洞！兜推了推圆眼镜，很淡定地转身回挂水室工作了。
在九雀利用十片指甲往卡卡西手背上抓出十公分长的印子之后，卡卡西将她放下了。“接招！”九雀脚一沾地就像只灵巧的狐狸一样飞蹿起来，一拳袭向卡卡西的鼻子。卡卡西抬手，用手掌抱住了她的拳头，轻描淡写地化解了攻击：“你是真不知道还是假不知道啊？”卡卡西用一只看似无精打采的眼睛看着她。九雀气疯了，她那么努力地训练，居然差卡卡西那么多！“什么？”
卡卡西又翻了个白眼：感觉这人有时候很精明，知道不少东西，但有时候又迟钝的厉害。“你难道没感觉到村子里近来很多事吗？这种时候就应该尽可能低调。”九雀恍然大悟，最近又是宇智波的改革，又是忍者失踪，团藏似乎也不安分。“那些事情怎么会牵连到我这个小小的暗部身上呢？”见卡卡西还想说些什么，九雀打断他：“你是担心大蛇丸老师的事情对我造成影响吧？安啦，身正不怕影子歪。”“你就那么确定大蛇丸大人没有做过……”
“啊喂！你不要在弟子面前说老师的坏话呀！”九雀叫起来。虽然上次九雀给大蛇丸作证，洗脱了他的嫌疑，但村子里大部分人还是认为下忍失踪的事是大蛇丸干的。而且最近还出现了下忍、中忍就在村子里突然消失了，若要说是外人做得，让人难以相信。卡卡西闭上嘴，不再说话。两人冷了场，不久有护士来催促卡卡西回病房休息，卡卡西告诫九雀少去骚扰幼童，然后一拐一拐地走了。后面的九雀直想打断他另一条腿。
后来木叶度过短暂的调整期，进入修养期，忍者都大量出任务以赚取金钱。暗部的任务有两种：一是见不得光的机密任务，二是非常危险的任务。后者的报酬很高，正是如今的木叶需要的，因此九雀在悠哉了一阵儿之后便陷入了出任务、交任务、出任务、交任务的地狱之中，没有空去找兜了。过了段天昏地暗的日子，都理不清时间到底流逝了多少，九雀在一日开门的时候，在自家门口见到了兜。
是大蛇丸陪着他来的，而且挑了晚上偷偷摸摸地前来，就像地下党接头似的。“大蛇丸老师，兜子，这么晚了有什么事吗？”九雀给他们倒了两杯白开水。“我想让你们认识一下。”大蛇丸道。这话说的奇怪，她和兜已经认得了，九雀有些不明白，但看着大蛇丸的眼睛又问不出口，只好藏在心里，等到之后慢慢思考。大蛇丸接着说：“但我不希望你们的感情过好。”又是让人搞不懂。“就是这样。”他没有碰那杯白开水，说完就走。兜向九雀规规矩矩地鞠了一躬，也离开了。
徒留下九雀盘腿坐在桌边盯着两杯温开水出神。想了半天，她似乎有些明白了。不知道出了什么岔子，兜现在已经是大蛇丸的人了，说不定在为大蛇丸打探团藏的情报。大蛇丸的意思是让他们知道，他们现在都是自己人，但是不需要太亲近，以免引起注意。由于九雀之前已经高调地调戏过兜，所以假装不熟悉是不可能的，只要把握尺度维持在关系不错的姐弟程度就行。
她突然想到去翻日历，发现这一日是10月9日。之前忙得时间感紊乱，根本不知道已经过了多久了，竟然一瞬来到了9号。明天，10月10日就是玖辛乃临盆的日子，这个世界的主角漩涡鸣人将会出生。带土已死，但有神秘人出现，他要下手的话也会选择这一天，也就是说虽然演员有了很大的改变，但剧情还会按照原有的轨迹继续下去吗？上战场也好，出任务也好，九雀都是不怵的，因为那是人力可抗的，但是九尾……就算她升到45级也办法！
刺客技能几乎都是近身招数，近九尾的身那不是找死吗？光是九尾的查克拉就足以把她灼死了！但她是暗部，不可能不上战场……不对，卡卡西也没上。是什么原因来着？九雀的脑子乱糟糟的，半天才想起来，三代为了保护年轻力量，卡卡西这一辈的都没有上战场。也就是说她也应该会被保护起来。这时任务提示出现。
主线任务“妖狐，来战”：
参加对抗九雀的战斗
帮助四代火影封印九尾
九雀一时甚至想要拼着不升级也不做任务了，但是看到任务奖励眼睛都直了——技能“无限流”、轻功“身轻如燕”。无限流是一个附加型辅佐技能，但效果不要太赞！九雀的技能冷却时间都蛮久的，无限流则弥补了这一点。它可以附加到任何攻击类技能上，在内力耗尽之前不定地施展该技能。比如她在使用月光斩的时候叠加了无限流，她就可以不停歇地使用月光斩、迷雾斩、晨露斩直到内力用完。这才是真正的连击啊！她知道剑灵里面是没有这个技能的，但是轻功都能异变成那样了，没什么不可能的。
还有身轻如燕，倒不是新的飞行方式，而是她能够自如地调整轻功的速度，而不像现在要么慢跑，要么飞蹿。总的来说是很实用的技能。而且不知道为什么，这次的奖励是分次给的，完成第一个条件领悟无限流，完成第二个领悟身轻如燕。
为了这两个技能，她都要硬着头皮上了！九雀怕死，但她自己也没有意识到，她是一个很冒险主义的人。她开始盘算怎样才能活下来并且完成任务，随后想起本来宇智波也全没上，如今他们为了战功绝对不会放过这个机会。到时候她就去抱止水大腿！