武居和花井开到了一处废弃的工厂，在一间仓库等了一会儿后，武居社长奇怪为什么绑匪还没有来呢？花井优雅地冷笑，“其实早就来了。”然后一把将武居推到了仓库里面，武居社长跌倒在地，“八嘎，好痛，你在干什么啊，你这个笨蛋，我的脚都扭伤了。”花井恨恨地说，“这能跟我全家的伤痛比较吗？你不记得这里了吗？这是我父亲当年的工厂，就当做是你并购公司的报应吧。”武居大惊失色，“什么？难道你是……”
花井说出了真相，花井亚希子的父亲被武居胜彦社长当年弄得工厂破产，全家自杀，她的弟弟昌作也因此而死，花井当时在念大学，只好让亲戚收养，改名换姓，进入武居的公司就是为了报仇。因此她与直子串通假装绑架来试探其父的心意。花井将报纸假钞堆到武居社长身前，“我一直这么想，如果你还爱着直子就会为她准备赎金，那么我就看在直子的面上，放弃报仇。但是……”武居社长大骇，“花井，你要干什么啊？”花井走到汽油桶前，“我要你死。”原来她欲用假币点火杀死武居胜彦报仇。武居社长惊慌失措，“等等，不要啊花井，如果你要钱的话我给你就是，快点停止。”
这时，花井准备点火了，“快住手啊，花井小姐，那种人他根本不配你杀！”千钧冲进来阻止了她，抢过了她手中的火机，武居胜彦急忙呼救。花井怒火冲天，“可是他也不配活着。”柯南过来说道，“难道你也要让直子有你这样的想法吗？”千钧也叹气，“花井，武居社长毕竟是直子的爸爸，失去亲人的痛苦你比任何人都更清楚。父女之间依然是血脉相连，打断骨头连着筋啊，你今天要真这么做了，以后怎么去面对直子呢？”花井跌坐在地，看着可爱的柯南，想起自己心爱的弟弟，上前抱住柯南放声大哭，柯南感受到了花井温柔的软胸轻轻地挤压，鼻血差点流出来。千钧也羡慕看着柯南，这个混蛋装小孩还真能占便宜啊。
突然，千钧身上蓝色的自然晶石出警报，“不好，直子有危险了，花井小姐，直子现在在哪里啊？”花井一愣，“直子就在离这不远的一家废弃厂房里，她应该很安全的。这次行动只有我和她两个人知道的。”千钧问明白方向，飞跑过去，花井也有些疑惑，抱着柯南也追出去。武居胜彦匆忙手脚并用从报纸钞票里面爬了出来，他爬到门口后，大口喘气，忍不住心里的害怕点了一支烟，等这支烟抽完后，习惯性地将烟头扔了出去，结果烟头掉到了花井泼的汽油上，这下子把整个废弃仓库点着了，武居社长急忙连滚带爬逃到外面。
等千钧赶到直子被囚禁的地方，看见地上躺着4个口吐白沫的流氓，直子横着凝霜剑躲在角落的死角地方，一个持枪的歹徒一边开枪一边叫嚣，“臭丫头，你给我滚出来，交出那把剑，再让我好好爽一把，我就饶了你。否则一枪毙了你……”这时，千钧冲了进来，歹徒回身向千钧开火，千钧七夕剑出鞘，险险地击飞了子弹。
歹徒目瞪口呆，他的手枪被瞬间切割成两半，然后华丽地吐血晕倒在地。千钧看了看地上，还有哀嚎的四个流氓，走过去一人踹了一脚，立即没了声音，“直子，是我，出来吧。”直子一脸紧张，拿着凝霜剑从里面跑了出来，扑到千钧怀里大哭起来。千钧抱紧，亲吻了直子，好不容易才让直子冷静下来。直子才说，“不知道怎么回事，本来我跟花井姐姐计划好想试试爸爸对我有多疼爱，可是今天这个厂房的门我却打不开了，害我一整天都闷在这里。”
原来，那5个家伙经常在附近惹是生非，这个废弃的厂房被他们当做偶尔的落脚点。他们这次过来是准备分赃的，前几天他们偷抢了不少东西。一个流氓现厂房上锁了，由于好奇，这群家伙就撬开了门锁，现了里面的直子。直子容貌俏丽，风姿动人，几个流氓见附近又没有别人，于是色心大起，准备上演一场少儿不宜的节目。直子现不对，就动用了凝霜剑自卫，于是先后击倒了4个流氓。为的歹徒猪田大惊，没想到直子的剑法如此了得，于是猪田就掏出了枪射击，直子只好绕着厂房周旋躲避，幸好这个厂房有不少遮挡物。
千钧怜意大生，“好了，直子现在没事，来，再让我吻一下，啊，真好，喂喂，你别踩我啊，我不是来了吗？”直子红着脸喘气，“又动手动脚，不要乱摸了，坏蛋色狼。”千钧好笑，“我们都同居那么久了还害羞，晚上你不是一直叫着那个吗？”直子羞恼，气得拿剑砍他，千钧大叫，“谋杀亲夫啊！”二人追逐打闹了一会，千钧将直子抱住，殷殷道歉，才算结束。犹豫了一下，千钧还是将外面的事情仔细告诉了直子。
直子一下子蒙住了，好一会儿才反应过来。这时花井带着柯南才上气不接下气地赶到这里，看到地上的5人众，花井大吃一惊，跑过来抱住直子，“直子，你没事吧，你可别吓我。”直子伸手抱住花井，“花井姐姐，你放心好了，我没事的。”柯南有些惊讶，“喂，千钧，你怎么会知道直子有危险的，居然准确地找到了直子的所在地，花井小姐也只是告诉你大概的方向，难道你以前到过这里吗？”
千钧暗道，柯南可不向毛利侦探那么好糊弄，“哈哈，柯南，不是跟你解释过吗？这就叫做心心相印，冥冥之中自有定数。你出事那天晚上，小兰不是也颇有不祥的预感吗？”柯南彻底无语，作为一个坚定的无神论者，他本来也是不相信这些奇妙的事情，不过，想起小兰，他就说不出话来。
直子和花井互诉衷肠，花井见直子已经知道了事情的真相，“直子，对不起，真的很抱歉，是我做的过分了，把你牵扯进来了，又没有考虑你的感受，你能原谅我吗？”直子抱紧花井，流着泪，“花井姐姐，你不要说了，你没事就好。我只当没有那个混账爸爸，我们以后还像以前一样，好吗？都是我爸爸对不起你，还有你们全家。”看着哭做一团的二女，千钧真的无语，“喂，你们两个先不要忙着求对方谅解好吗？就当是你们姐妹之间的一次误会好了，现在不是已经雨过天晴了吗？”
花井帮助直子擦干眼泪，“好了，直子，你要坚强些，事情都是我弄出来的，我会去向警方自，我不在的时候你要照顾好你自己啊。”直子急忙说，“不要啊，还是我去吧，我去给目暮警官说，是我让你故意绑架我来试探爸爸的，相信目暮警官不会追究的。柯南，千钧，你们说是不是？”柯南摇头，“不行啊，就算你这样说，武居社长还会告花井小姐蓄意谋杀的，而且一连串的绑架行动总要有个交代的，这可是刑事案件。”花井安抚直子，“还是我去自，直子，你不要再劝我了。”千钧冷笑，“柯南，这个遗祸江东的办法，你不擅长，交给我好了，我保证所有人都会平安无事。前提是大家必须统一好口径，千万别说漏嘴啊。”
大家都看着千钧，直子大喜，“千钧，你别糊弄我，你有什么好办法吗？”千钧露出笑容，踢了一脚持枪歹徒猪田，“这个家伙不是现成的绑匪吗？我们就把所有罪名推倒他头上好了。我们几个都一口咬定，到前面那个废弃仓库交付赎金后，跟踪来到这里救出了直子。直子，你就说开始被一个持枪蒙面人绑架了，一直被关在这里，什么都不知道。
后面他们几个意图非礼你的事情，你就实话实说就行。”柯南满头黑线，“就算我们这么说，警方一问这几个家伙，不全都露底了。”千钧冷笑，“柯南，你听说过囚徒困境理论吧，我来点醒一下那4个流氓，看他们的样子，罪行应该比这个拿枪的轻很多，让他们也都一口咬定是这个持枪歹徒绑架人质就可以了，就算这个歹徒不承认，别人也不会相信他。”
柯南苦笑，这个办法未必好使，不过事到如今，只好试试了。千钧过去挨个将4个流氓弄醒，每个人都说了几句话，又随后被千钧打昏，千钧倒是弄清楚了猪田的姓氏。花井和直子有些糊涂，“柯南，什么是囚徒困境啊？”柯南简单了解释了一下，“囚徒困境”讲的是两个犯罪嫌疑人在共同作案被逮捕之后，警察在分别审讯中会告诉他们：“如果都坦白，每人判刑8年；如果都抵赖，各判刑一年（因证据不足）；如果一人坦白，一人抵赖，坦白者判刑4年，而抵赖者判刑12年。”在这样一个前提之下，两个嫌疑人基本上都会选择“坦白”，因为这符合个人的最大利益，这个故事揭示的是生活中的普遍现象，即“个人理性”与“集体理性”之间的尖锐矛盾。
这个方法关键就在于那4个流氓心智是否坚定，如果是自私自利的人，就会自动陷入囚徒困境。如果他们相信伙伴，一起抵赖，反而能够脱困而出。不过这个案子稍微有所不同，他们意图非礼直子、盗窃财物是无论如何也抵赖不过的。柯南见二女惊讶看着他，急忙说是听毛利叔叔告诉自己的，花井和直子这才点头，也有点明白了千钧的用意，不过，他们跟柯南一样有同样的担心。
等千钧忙乎完了，柯南摇头，“千钧，还有个最大问题，就是武居社长那里，如果他不肯配合，还是会穿帮的。”直子走过来，恨恨地说，“我们一起去见爸爸，我来说服他，如果他不肯帮忙，我就跟他断绝父女关系。”柯南苦笑，武居社长好像不太在乎这个女儿啊。等他们4个赶回废弃仓库时，才现那里已经着起大火了，大家全吃了一惊，一起向前跑去。还好，在废弃工厂的门口看见了满头大汗的武居胜彦，大家都松了口气，这时候外面也响起了消防车和警车的声音。
花井奇怪，“我们离开时还好好地，怎么会起火呢？”柯南看见武居社长在不停地擦汗，走到跟前闻到烟味，立即明白了，这火应该是武居不小心点着的。千钧也看出来了，那些钱虽然多是报纸，但上面那层都是真的，以武居社长的个性，正常的话应该会把那些钱拿走的，除非这火起得仓促，他自己也没来得及收拾。武居看到女儿没事，也露出些笑意，只是有些不大自然。父女二人见面反而一时不知道该说什么。
千钧过去，拉过武居社长，“武居社长，这火是你放得吧？据我所知这个纵火的罪名可不轻啊，少说也要判刑2年，对了，还有罚款赔偿，很多钱的。”武居社长擦汗，“那怎么办？可恶，我不是故意的，只是抽了一根烟而已。”千钧微笑，“你是直子的爸爸，看在直子的份上，我们会帮你作证的，不过，你也要帮我个小忙。”
二人商量完后，消防队与目暮警官带着一帮警察也到了，原来由美把千钧要求协助追踪武居社长汽车去向的消息告知了佐藤警官，佐藤警官觉得蹊跷，立即通知了目暮警官。目暮警官也猜到了绑匪可能还在勒索，觉得问题严重，根据交通局的消息，立即带队赶了过来，因此和消防队一起到了出事地点。目暮警官刚下警车，看到千钧拍着武居的肩膀，“哈，武居社长，真是的，这个绑匪还真是穷凶极恶啊，差点烧死你和花井小姐，你现在没事了吧？”武居社长立即反应过来，“没事了，多亏了你和这个孩子赶来将我们救了出去，直子也没事了，太好了，多谢你了。”
消防队长指挥队员灭火，还好这里是废弃厂房，没有什么人。目暮警官脸色不善走过来，后面跟着高木警官和佐藤警官，宫本由美也来了，她冲上去拉住直子仔细看了一遍，确认直子确实没事，才算放心了。千钧上来答话，“目暮警官，绑匪已经被我击倒了，在后面那个废弃厂房里面。”目暮警官点头，“八嘎，千钧，你为什么不先通知我们警方，怎么老是私自行动，简直太乱来了。”
大家赶到囚禁直子的厂房，路上千钧如此阐释了整个过程，武居和花井去交付赎金，绑匪猪田现了武居社长钱里掺杂报纸，一怒之下放火，想要烧死他们。千钧和柯南赶到，将二人救了出来，随后又追踪猪田，找到了直子的藏身之地。4个流氓想要非礼直子，直子凑巧挣开了绳子，拿到剑才打倒了4个流氓。随后，回来的猪田拿着枪威逼直子，千钧及时赶到击倒了猪田。
在囚禁之处，大家看到依然昏倒在地的5个家伙，以及一地的赃物。高木警官上前辨认，“目暮警部，这些都是最近晚上失窃和被打劫的钱物哦，这里还有一张主人的证件呢。”佐藤也低身观看，“这几件没有接到报失的钱物应该是今天晚上刚做的案吧，还没来得及清理。看了，他们已经作案很久了。”目暮警官点头，相信了千钧的话。佐藤觉得有些疑惑，事情未免太凑巧了点，而且起火的时间与千钧救出直子的时间似乎相隔短了点。
高木却没什么感觉，“哈，好了，佐藤警官，大家都安全就最好了。现在犯人都抓住了，我们也放心了。”佐藤摇了摇头，询问了花井和武居胜彦、直子三人，大家的说辞都差不多。千钧暗暗叫苦，知道佐藤起了疑心，“佐藤警官，你好像不大相信我哦，这样，你问柯南好了，小孩子最不会说谎了。”佐藤警官笑着拉过柯南，仔细询问起来，柯南故意装可爱，回答的滴水不漏。
佐藤见柯南也如此回答，由美好笑，“喂，美和子，你到底在瞎怀疑什么啊，这不是事情都明摆着吗？连我这个外行都看出来就是这个猪田带人绑架了直子的。”佐藤摇头，叫直子过来，询问车沉入海的详细经过，直子并不知道这件事，自然是一问三不知。
千钧上前，把柯南的推理简单说了一遍，当时的人只有绑匪一个，应该是绑匪扮成直子故意试探是否有警察介入的。这时，经过几个警察采取了急救措施，那4个流氓也醒过来，他们都一口咬定绑架跟他们没关，都是领头的猪田自己搞出来的，他们只负责协助偷盗东西。猪田清醒过来后，大叫冤枉，他对绑架直子、蓄意纵火、偷盗抢劫伤人等所有事情一概予以否认，大呼自己是良好市民，显然深明坦白从宽牢底坐穿的道理。
目暮警官冷笑，事实都摆在眼前，这个猪田还在装糊涂，这家伙明显是个累犯，以前就把他抓进去过。猪田明白检察机关的起诉程序，所有才什么都不承认，居然还叫嚣着要找律师。这次，连佐藤警官也看出猪田在撒谎，自然也不相信他说的话。目暮警官挥手，高木点头，和几个警官将这个5个家伙全部带上警车。目暮警官正了正帽子，大吼，“花井小姐，武居社长，你们怎么回事？”
花井脸色苍白，武居直接跌坐在地，羞惭满面。目暮警官继续批评，“既然直子小姐还活着，绑匪还在活动，你们为什么不通知我们警方？你们知不知道那是非常危险的事情？还有，武居社长，你竟然拿假币报纸就想蒙混过关，简直胡闹，那不是拿你女儿直子的性命开玩笑吗？要不是千钧赶到你们早被烧死了！”大家都松了一口气，所有的人都鄙视坐在地上哑口无言的武居胜彦。千钧露出笑容，终于蒙混过关了。
目暮警官转过身，“千钧，你笑什么啊，可恶，你既然知道了事情原委，应该马上打电话告知我。还有，你竟然带着柯南这个孩子出来进行这么危险的事情，简直是太过头了，如果柯南有什么事情，你怎么向毛利交代？”千钧只好不停向目暮警官哈依道歉。直子虽然恼恨父亲不顾自己的死活，还是走过去将无地自容的武居胜彦扶了起来，武居有些羞愧，“直子，是爸爸不好，你原谅我一次好吗？”直子给他个背影，走过去抱住花井低声抽泣起来。
尾声，尽管猪田否认自己的一切罪行，法庭经过警方和检察机关的取证，也知道了猪田有多起犯罪嫌疑，手上还有人命，法官又听从了陪审团的一致意见，认定猪田多次盗窃、抢劫、杀人、绑架、纵火等各项罪名成立，加重判处3o年徒刑。
4个流氓罪行较轻，都只是盗窃和抢劫的从犯，均被判处3年徒刑。千钧擒获这个盗窃抢劫团伙5人，警视厅给以b级奖励。千钧带着柯南进行如此活动，被随后赶来的小兰严厉谴责，其后小兰抱住柯南低声安慰，柯南舒服地把头埋在小兰怀里享受温柔，千钧恨得牙痒痒的。而所有的同学都为直子成功脱险感到高兴，大家一起举办了一次庆祝活动，祝贺直子平安归来。