中心岛屿这一边，战斗已经打响了，虽然复制神奇宝贝爆发出强大的实力，顽强的抵抗火箭队的攻击，但毕竟缺少指挥，被火箭队分割开来一个一个捕捉，最终败下阵来，小智这一边也遇到了麻烦…
“这是什么？”小智他们在下楼梯的时候正常撞上了捕捉器，全部被牢牢套住，虽然小智有有办法让自己的挣脱，不过朵迷诺带着火箭队成员出现了，小智不能出手，地方太小，打起来恐怕无法顾及后面的小霞，小刚他们。
“我们要找的对象不是人类，而且神奇宝贝，不过既然知道了这个岛的秘密，那就另当别论了，所以不能轻易放你们离开。”朵迷诺拿着她的郁金香妩媚的说到。
小智虽然很想和打败他们，不过现在没什么办法可行，却只能怪怪停他们的。
另一边，板木抓住了中心岛屿上的全部复制神奇宝贝，开始威胁超梦。“这个能量场并不是用来打倒你的……”坂木微笑的看着超梦，“而是用来支配你的精神，让你的心灵能够按我们所想的改变……成为我火箭队的忠实手下！”
“如何？超梦，你要如何选择？是就这样抛下同伴独自逃跑，还是为了同伴牺牲自己？”
超梦眯起眼睛，用不信任的语气问道：“如果我进到那个里面，你如何保证你会放过我的同伴们？”
“我的实力就是保证。”坂木老大正色回答道，伸手划过下面众多的火箭队部队。“我的强大军团相比，区区几只复制小精灵根本不值一提！如果不是你的缘故，这些家伙根本不会引起我的注意。”
“……希望你会信守承诺。”低头不语沉默良久，超梦终于迈开步子，缓缓向机器人中间的红色光球走去。作为伴奏的，是不远处瘫在地上的复制小精灵们的哀嚎声。
终于，超梦的身躯整个都没入到光球之中。在坂木老大胜券在握一般的笑容中，能量光球被机械人发出的牵引光束缓缓升到半空中，然后超梦被光球内部突然窜起的电流控制全身，发出压抑后的低声惨叫……
围观群众周防幽看得一头黑线：坂木大叔你确定这玩意真的只是用来洗脑的而不是神马变态刑具？
或者是因为被超梦给摔过，所以觉醒了什么别的功能……
“我是……不会输的……”在电弧乱窜的光球中超梦咬着牙勉力抬起头来，“就算…我的身体被你控制…我也不会把心灵交给你！”
“是么……那么是你的意志力胜利，还是我的科学力胜利，我就拭目以待了。”坂木再次笑了笑，转身拿起对讲机，“通知后续部队，基地的建设工作可以开始了。”
“进去吧。”朵迷诺将小智他们带入地牢，先将他们关起来。“你们是无法逃脱的。”说完，朵迷诺便离开了，她可没时间陪小智他们玩，基地建设还需要她指挥。
“皮卡丘，没事吧。”小智抱起来皮卡丘。
“皮卡皮卡~”（我没事。）
“小智，接下来我们要怎么办。”小刚问道。
“不知道，先等等吧。”
火箭队他们在热火朝天的建设，完全不顾环境问题，将大量污水排入湖中，污染了水源，这可恼怒了下游的虫系神奇宝贝，它们发誓要人类付出代价。
大量的虫系神奇宝贝入中心岛屿，对着火箭队成员就是攻击，一个火箭队成员一不小心，将切割火枪掉进燃料储存区，引起大爆炸。
“怎么回事？”板木目瞪口呆的看着满头飞舞的虫系神奇宝贝。
爆炸的冲击将门口的守卫全部炸飞，连小智他们的牢房也被炸开，小智他们全部吹的人仰马翻。
“太好了，我们可以出去了。”小智站起来说到。
“好，大家到这里来。”小智对着大家说到，不过贝尼博士和露娜小姐却去了另一边，看来他们很担心泉水。
横穿基地时无一人阻拦，因为他们正面临大量虫系神奇宝贝的攻击，没时间顾及那么多。小智一伙顺利到达湖边战场。周围依然是不出所料的一个火箭队都没有，只有摆出两个的机器人，和两个机器人不断压制，加上之前战斗时受的伤，看上去已经出气多进气少的超梦。
“超梦，我马上来救你。”小智先退后几步，放出喵喵“皮卡丘，喵喵，对着机器人使用十万伏特！”
小智的皮卡丘和喵喵同时纵身一跃，在半空中放出一道闪亮的粗大电流，打在两边的机器人的身上，这次机器人开始颤抖，
十万伏特强劲的电流烧毁了机器人里面精密的电路，身体各处冒出噼里啪啦的电火花，随即爆炸成一团烟火。
失去了机器人后，被困在空中超梦的光球的能量自然无法再保持平衡，而超梦也空空中掉落了下来。
“成功了！”小智欢呼到“赫拉克罗斯，接住超梦。”
赫拉克罗斯出来马上接住了掉下来的超梦，避免它再受到伤害。
“超梦！”小智连忙跑过去和赫拉克罗斯一起扶起超梦。“小刚，有没有给小精灵疗伤的药？快拿过来——超梦它伤得很重！”
“啊，是！”小刚连忙从背包里翻出喷雾器造型的小精灵用疗伤药物跑过来。
“你是……那个时候的……”这时让本来已经近乎昏迷状态的超梦清醒了过来，睁开眼睛就看到了一脸焦急的小智。“为什么…要救我……”
“这不需要任何理由。”小智摸摸头，挤出一副笑脸，“但是看到受伤的小精灵，我没理由只是站在一边什么都不做吧？如果是你你也会和我做一样的事情。”
“……不行啊小智！”拿着喷雾器在超梦身上忙活了好一会的小刚皱紧眉头叫道，“超梦的伤势太严重了，普通程度的治疗根本没有效果！”
“不用白费力气了……”超梦缓缓地摇了摇头，“声音”中透出掩饰不住地虚弱。“我的情况我自己清楚，这具身体已经超出了极限，已经没救了……”
“可恶！就没有别的办法了吗？”小智懊恼地一拳砸在地上，“对了……清澈泉，清澈泉水可以治疗神奇宝贝，它一定可以治好超梦。赫拉克罗斯，带着超梦跟我走。”
“我不是让你这么做的，小智。”这时候板木带着火箭队出来阻挠了。
“小智，快走，这里交给我们吧。”小刚，小霞和那些复制神奇宝贝都挡在了板木面前，为小智救超梦赢得时间。
“那就交给大家了，赫拉克罗斯，伊布我们走，皮卡丘和喵喵留下了帮忙。”小智也马上带着超梦离开。
“为什么，为什么你们要帮助我。”超梦还是不解的问道，它还是无法完全相信人类。
“因为你救过皮卡丘，也帮助过许多神奇宝贝，这还是要理由”小智一副理所当然的回答到。
“就因为这样？”
“没错，这算是报答。”
“说不定你是个特别的人，特别的训练家。”
“你不也是和特别的神奇宝贝吗？”
“呵，我还没有搞清楚，自己到底是谁？”超梦自嘲的笑到。
“不，答案其实早就知道了，你就是超梦，超梦就是你，世界上独一无二的，神奇宝贝。”
“我…是超梦。”
几分钟后，依旧是一路上无人阻拦的一行人来到了位于岛屿中心处的清澈泉。虽然泉水旁边的草地上已经搭起了数顶帐篷并堆满了不少研究用机械，还看到了两个熟人。
“小智君，你怎么在这里？这只小精灵怎么了？”贝尼博士和露娜小姐正蹲在水池边，庆幸泉水完全没受到污染，看到小智带着超梦走过来下意识地开口问道。
“超梦它受了很重的伤，”小智解释道，“我想这个泉水说不定能救它”
“原来是这样。”胡渣博士很干脆地将手中装满泉水的试管递了过去，“快让它把这个喝下去吧！”
“不，单喝是没有用的，它需要大量的水。”小智让赫拉克罗斯举起超梦。
“等等，这里有很重要的成分，说不定能拯救人类。”贝尼博士好像知道小智要怎么做，出来阻止。
“但我现在只想救的，就是它。”小智才不管以后是否会不会可以拯救人类，让赫拉克罗斯把超梦丢进湖里。
“还是迟了一步吗？”板木这时候坐在飞机出现在小智他们面前。“不过算了，这里的一切都属于我。”
“我不会让你得逞的，板木。”这时候伤势全好的超梦出来了，“这里即不属于你，也不属于我，我不会让你伤害任何人的。”
超梦开始释放全部精神力，“在这里…释放我的所以力量吧。”强大的力量席卷了整个清澈湖，爆发出耀眼的光芒，让所有人都睁不开眼。
等光芒散去，所以清澈泉水都不见了，剩下的是光秃秃的地面和火箭队成员，其中小智一行人和复制神奇宝贝都不见了，不过由于情况太震撼了，大家都忽略了这一点。
“完了…”贝尼博士失魂落魄的跪坐的地上。
而小智他们被超梦移到了地下，在那里，超梦早就做好了一个地下室。
“我把水移到了这里，这样就不会有人发现了。”
“是吗？超梦，你的力量真强。”小智看着面前的湖水说到。
“等一下我会消除所以对这里不利的人关于这里的事情。对了，上次你为什么没有被消除记忆。”超梦一直很好奇这件事。
“因为我是有波导的人。”小智全身散发出淡蓝色的波导，这些波导可以保护他。
“真是特别的人类。”
大量的巴大蝴出现，对着火箭队的人挥洒大量睡眠粉，让他们陷入沉睡，然后消除他们的记忆，连板木也不例外，他和超梦的关系从此断裂。
“旅行即将开始。”在火箭队离开后，超梦准备带着复制神奇宝贝正真投入世界，投入生活。
“超梦，以后要多保重。”小智站在超梦面前说到。
“你也去，小智。”说完，超梦带着所以复制神奇宝贝离开了，而小智他们也继续旅行。
“我们还会见面的，超梦。”小智回头看了看飞远的超梦，心想到。
ps:一定有人问为什么不收超梦？超梦对我来说现在还不是收服的时候，它还在为自己的存在迷茫，还需要成长，等下次见面的时候，它将以全新的面貌和小智相遇。